LCOV - code coverage report
Current view: top level - synthesis/TransformMachines2 - CFBuffer.cc (source / functions) Hit Total Coverage
Test: casacpp_coverage.info Lines: 0 281 0.0 %
Date: 2024-10-04 18:58:15 Functions: 0 30 0.0 %

          Line data    Source code
       1             : // -*- C++ -*-
       2             : //# CFBuffer.cc: Implementation of the CFBuffer class
       3             : //# Copyright (C) 1997,1998,1999,2000,2001,2002,2003
       4             : //# Associated Universities, Inc. Washington DC, USA.
       5             : //#
       6             : //# This library is free software; you can redistribute it and/or modify it
       7             : //# under the terms of the GNU Library General Public License as published by
       8             : //# the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or (at your
       9             : //# option) any later version.
      10             : //#
      11             : //# This library is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
      12             : //# ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
      13             : //# FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU Library General Public
      14             : //# License for more details.
      15             : //#
      16             : //# You should have received a copy of the GNU Library General Public License
      17             : //# along with this library; if not, write to the Free Software Foundation,
      18             : //# Inc., 675 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139, USA.
      19             : //#
      20             : //# Correspondence concerning AIPS++ should be addressed as follows:
      21             : //#        Internet email: casa-feedback@nrao.edu.
      22             : //#        Postal address: AIPS++ Project Office
      23             : //#                        National Radio Astronomy Observatory
      24             : //#                        520 Edgemont Road
      25             : //#                        Charlottesville, VA 22903-2475 USA
      26             : //#
      27             : //# $Id$
      28             : #include <synthesis/TransformMachines2/CFBuffer.h>
      29             : #include <synthesis/TransformMachines2/Utils.h>
      30             : #include <casacore/casa/Utilities/BinarySearch.h>
      31             : #include <casacore/coordinates/Coordinates/SpectralCoordinate.h>
      32             : #include <casacore/casa/Utilities/Assert.h>
      33             : 
      34             : using namespace casacore;
      35             : using namespace casa::vi;
      36             : using namespace casacore;
      37             : 
      38             : namespace casa{
      39             :   using namespace refim;
      40             :   // Instantiate a commonly used extern template
      41             : 
      42             :   //
      43             :   //---------------------------------------------------------------
      44             :   //
      45             :   //
      46           0 :   void CFBuffer::setParams(const CFBuffer& other)
      47             :   {
      48           0 :     wValues_p.assign(other.wValues_p);
      49           0 :     freqValues_p.assign(other.freqValues_p);
      50           0 :     muellerElements_p.assign(other.muellerElements_p);
      51           0 :     muellerElementsIndex_p.assign(other.muellerElementsIndex_p);
      52           0 :     conjMuellerElements_p.assign(other.conjMuellerElements_p);
      53           0 :     conjMuellerElementsIndex_p.assign(other.conjMuellerElementsIndex_p); 
      54           0 :     wValIncr_p = other.wValIncr_p; 
      55           0 :     freqValIncr_p = other.freqValIncr_p;
      56           0 :     muellerMask_p.assign(other.muellerMask_p);
      57           0 :     pointingOffset_p.assign(other.pointingOffset_p);
      58           0 :     freqNdxMapsReady_p = other.freqNdxMapsReady_p;
      59             : 
      60           0 :     freqNdxMap_p.assign(other.freqNdxMap_p);
      61           0 :     for(uInt i=0;i<freqNdxMap_p.nelements();i++) freqNdxMap_p[i].assign(other.freqNdxMap_p[i]);
      62           0 :     conjFreqNdxMap_p.assign(other.conjFreqNdxMap_p);
      63           0 :     for(uInt i=0;i<conjFreqNdxMap_p.nelements();i++) conjFreqNdxMap_p[i].assign(other.conjFreqNdxMap_p[i]);
      64           0 :     cfCacheDirName_p = other.cfCacheDirName_p;
      65           0 :   }
      66             :   //---------------------------------------------------------------
      67             :   //
      68             :   //
      69           0 :   CountedPtr<CFBuffer> CFBuffer::clone()
      70             :   {
      71           0 :     CountedPtr<CFBuffer> clone=new CFBuffer();
      72           0 :     clone->setParams(*this);
      73             : 
      74           0 :     IPosition shp(cfCells_p.shape());
      75           0 :     clone->resize(shp);
      76           0 :     clone->allocCells(cfCells_p);
      77             :     // clone->show("####CLONE: ",cerr);
      78           0 :     return clone;
      79           0 :   }
      80           0 :   void CFBuffer::allocCells(const Cube<CountedPtr<CFCell> >& cells)
      81             :   {
      82           0 :     IPosition shp(cells.shape());
      83           0 :     for (Int i=0;i < shp[0]; i++)
      84           0 :       for (Int j=0; j < shp[1]; j++)
      85           0 :         for (Int k=0; k < shp[2]; k++)
      86             :           {
      87           0 :             cfCells_p(i,j,k) = cells(i,j,k)->clone();
      88             :           }
      89           0 :   }
      90             :   //---------------------------------------------------------------
      91             :   //
      92             :   //  template<class T> Int CFBuffer<T>
      93           0 :   Int CFBuffer::noOfMuellerElements(const PolMapType& muellerElements)
      94             :   {
      95           0 :     Int n=0,nrows = muellerElements.nelements();
      96           0 :     for (Int i=0;i<nrows;i++)
      97           0 :       n+=muellerElements(i).nelements();
      98           0 :     return n;
      99             :     // Int n=0;
     100             :     // for(Int i=0;i<muellerElements.nelements();i++)
     101             :     //   for(Int j=0;j<muellerElements(i).nelements();j++)
     102             :     //  if (muellerElements(i)(j) > n) n=muellerElements(i)(j);
     103             :     // return n;
     104             :   }
     105             :   //
     106             :   //---------------------------------------------------------------
     107             :   //
     108           0 :    void CFBuffer::clear()
     109             :   {
     110           0 :     IPosition shp(cfCells_p.shape());
     111           0 :     for (Int i=0;i < shp[0]; i++)
     112           0 :       for (Int j=0; j < shp[1]; j++)
     113           0 :         for (Int k=0; k < shp[2]; k++)
     114             :           {
     115           0 :             cfCells_p(i,j,k)->clear();
     116             :           }
     117           0 :   }
     118             :   //
     119             :   //---------------------------------------------------------------
     120             :   //
     121             :   //  template<class T>  void CFBuffer<T>
     122           0 :   void CFBuffer::resize(const Double& wIncr, const Double& freqIncr,
     123             :                         const Vector<Double>& wValues, 
     124             :                         const Vector<Double>& freqValues,
     125             :                         const PolMapType& muellerElements,
     126             :                         const PolMapType& muellerElementsIndex,
     127             :                         const PolMapType& conjMuellerElements,
     128             :                         const PolMapType& conjMuellerElementsIndex
     129             :                         )
     130             :   {
     131           0 :     wValues_p.assign(wValues);
     132           0 :     freqValues_p.assign(freqValues);
     133           0 :     wValIncr_p = wIncr;
     134           0 :     freqValIncr_p = freqIncr;
     135             :     //    muellerMask_p.assign(muellerElements);
     136             : 
     137             :     //    nPol_p=noOfMuellerElements(muellerMask_p);
     138           0 :     nPol_p=noOfMuellerElements(muellerElementsIndex);
     139           0 :     nChan_p = freqValues_p.nelements();
     140           0 :     nW_p = wValues_p.nelements();
     141             : 
     142             :     //    muellerElements_p.resize(nPol_p);
     143           0 :     muellerElements_p.assign(muellerElements);
     144           0 :     muellerElementsIndex_p.assign(muellerElementsIndex);
     145           0 :     conjMuellerElements_p.assign(conjMuellerElements);
     146           0 :     conjMuellerElementsIndex_p.assign(conjMuellerElementsIndex);
     147             :     // Resize the various aux. information storage buffers.
     148             :     //
     149             :     // Resize the storage.  Retain the value of the existing pixels.
     150             :     // New pixels due to resize, if any, are assigned a new Array<T>
     151             :     // pointer.
     152           0 :     cfCells_p.resize(nChan_p, nW_p, nPol_p, true);
     153             : 
     154           0 :     for (uInt i=0;i<cfCells_p.shape()(0);i++)      // nChan_p
     155           0 :       for (uInt j=0;j<cfCells_p.shape()(1);j++)    // nW_p
     156             :         {
     157           0 :           Int k=0;                                 // nPol_p
     158           0 :           for(uInt prow=0;prow<muellerElements_p.nelements();prow++)
     159           0 :             for(uInt pcol=0;pcol<muellerElements_p(prow).nelements();pcol++)
     160             :               {
     161           0 :                 if (cfCells_p(i,j,k).null()) cfCells_p(i,j,k) = new CFCell;
     162           0 :                 if (cfCells_p(i,j,k)->storage_p.null()) cfCells_p(i,j,k)->storage_p=new Array<TT>;
     163           0 :                 cfCells_p(i,j,k)->freqValue_p = freqValues(i);
     164           0 :                 cfCells_p(i,j,k)->freqIncr_p = freqIncr;
     165           0 :                 cfCells_p(i,j,k)->wValue_p = wValues(j);
     166           0 :                 cfCells_p(i,j,k)->wIncr_p = wValIncr_p;
     167           0 :                 cfCells_p(i,j,k)->muellerElement_p = muellerElements_p(prow)(pcol);
     168           0 :                 cfCells_p(i,j,k)->xSupport_p = 0;
     169           0 :                 cfCells_p(i,j,k)->ySupport_p = 0;
     170           0 :                 k++;
     171             :               }
     172             :         }
     173           0 :   }
     174             :   //
     175             :   //---------------------------------------------------------------
     176             :   //
     177             :   //  template <class T>  void CFBuffer<T>
     178             :   // RigidVector<Int, 3> CFBuffer::setParams(const Int& inu, const Int& iw, const Int& muellerElement,
     179             :   //                                      const TableRecord& miscInfo)
     180             :   // {
     181             :   //   RigidVector<Int,3> ndx = setParams(inu, iw, 
     182             :   //                                   miscInfo.coordSys, miscInfo.sampling,
     183             :   //                                   miscInfo.xSupport,miscInfo.ySupport,
     184             :   //                                   miscInfo.freqValue, miscInfo.wValue,
     185             :   //                                   muellerElements, 
     186             :   //                                   miscInfo.fileName, miscInfo.conjfFreq,
     187             :   //                                   miscinfo.conjPoln);
     188             :   //   cfCells_p(ndx(0), ndx(1), ndx(2))->telescopeName = micsInfo.telescopeName;
     189             :   // }
     190             :   //
     191             :   //---------------------------------------------------------------
     192             :   //
     193             :   //  template <class T>  void CFBuffer<T>
     194           0 :   RigidVector<Int, 3> CFBuffer::setParams(const Int& inu, const Int& iw, const Int& ipx, const Int& ipy,
     195             :                                           const Double& freqValue,
     196             :                                           const Double& wValue,
     197             :                                           const Int& muellerElement,
     198             :                                           CoordinateSystem& cs,
     199             :                                           const TableRecord& miscInfo)
     200             :   {
     201           0 :     float sampling; miscInfo.get("Sampling",sampling);
     202           0 :     int xSupport, ySupport; miscInfo.get("Xsupport",xSupport);miscInfo.get("Ysupport",ySupport);
     203           0 :     String fileName; miscInfo.get("Name",fileName);
     204           0 :     double conjFreq; miscInfo.get("ConjFreq", conjFreq);
     205           0 :     int conjPoln; miscInfo.get("ConjPoln", conjPoln);
     206           0 :     String telescopeName; miscInfo.get("TelescopeName", telescopeName);
     207           0 :     String bandName;
     208           0 :     if (miscInfo.isDefined("BandName")) miscInfo.get("BandName", bandName);
     209           0 :     else bandName="UNKNOWABLE";
     210           0 :     float diameter; miscInfo.get("Diameter", diameter);
     211             :     // In the absense of evidence, assume that users are sensible and
     212             :     // are using AWProjection where it is really need it and not for
     213             :     // using it as a replacement for rotatially symmetric stuff.  So
     214             :     // by default, the CFs are assumed to be rotationally asymmetric.
     215           0 :     bool isRotationallySymmetric=True; 
     216             :     
     217           0 :     if (miscInfo.isDefined("OpCode"))
     218           0 :         miscInfo.get("OpCode",isRotationallySymmetric);
     219             : 
     220             :     RigidVector<Int,3> ndx=setParams(inu, iw, ipx, ipy, freqValue, bandName, wValue, muellerElement, cs,
     221             :                                      sampling, xSupport, ySupport, fileName, conjFreq, conjPoln, telescopeName,
     222           0 :                                      diameter);
     223           0 :     cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->isRotationallySymmetric_p = isRotationallySymmetric;
     224           0 :     return ndx;
     225           0 :   }
     226           0 :   RigidVector<Int, 3> CFBuffer::setParams(const Int& inu, const Int& iw, const Int& /*ipx*/, const Int& /*ipy*/,
     227             :                                           const Double& freqValue,
     228             :                                           const String& bandName,
     229             :                                           const Double& wValue,
     230             :                                           const Int& muellerElement,
     231             :                                           CoordinateSystem& cs,
     232             :                                           Float& sampling,
     233             :                                           Int& xSupport, Int& ySupport, 
     234             :                                           const String& fileName,
     235             :                                           const Double& conjFreq,
     236             :                                           const Int& conjPoln,
     237             :                                           const String& telescopeName,
     238             :                                           const Float& diameter)
     239             :   {
     240           0 :     RigidVector<Int,3> ndx=getIndex(freqValue, wValue, muellerElement);
     241           0 :     ndx(0)=inu; ndx(1)=iw;//ndx(2) = muellerElements_p(ipx)(ipy);
     242           0 :     cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->sampling_p = sampling;
     243           0 :     cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->xSupport_p = xSupport;
     244           0 :     cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->ySupport_p = ySupport;
     245           0 :     cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->muellerElement_p = muellerElement;
     246           0 :     cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->conjFreq_p = conjFreq;
     247           0 :     cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->conjPoln_p = conjPoln;
     248           0 :     if (fileName != "")
     249           0 :       cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->fileName_p = fileName;
     250           0 :     cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->telescopeName_p = telescopeName;//String("EVLA");
     251           0 :     cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->diameter_p = diameter;//25.0;
     252           0 :     if (bandName != "") cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->bandName_p = bandName;
     253             : 
     254           0 :     Int index=cs.findCoordinate(Coordinate::SPECTRAL);
     255           0 :     SpectralCoordinate spCS = cs.spectralCoordinate(index);
     256           0 :     Vector<Double> val; val.resize(1);val(0)=freqValues_p(ndx(0));
     257           0 :     spCS.setReferenceValue(val);
     258             :     //val.resize();
     259             :     //val = spCS.increment();
     260             :     // val = cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->freqIncr_p;
     261             :     //spCS.setIncrement(val);
     262           0 :     cs.replaceCoordinate(spCS,index);
     263             : 
     264             :     // cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->freqValue_p = 
     265             :     //   cs.spectralCoordinate(cs.findCoordinate(Coordinate::SPECTRAL)).referenceValue()(0);
     266             :     // cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->freqIncr_p  = 
     267             :     //   cs.spectralCoordinate(cs.findCoordinate(Coordinate::SPECTRAL)).increment()(0);
     268             : 
     269           0 :     cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->coordSys_p  = cs;
     270           0 :     return ndx;
     271           0 :   }
     272             :   //
     273             :   //---------------------------------------------------------------
     274             :   //
     275           0 :   void CFBuffer::setPA(Float& pa)
     276             :   {
     277           0 :     RigidVector<Int,3> ndx(-1);
     278           0 :     Int nF=cfCells_p.shape()(0), nW=cfCells_p.shape()(1), nM=cfCells_p.shape()(2);
     279           0 :     for (Int i=0; i<nF; i++)
     280           0 :       for(Int j=0; j<nW; j++)
     281           0 :         for(Int k=0; k<nM; k++)
     282           0 :           cfCells_p(i,j,k)->pa_p=Quantity(pa,"deg");
     283           0 :   }
     284             : 
     285           0 :   void CFBuffer::setParams(Int& /*nx*/, Int& /*ny*/, CoordinateSystem& /*cs*/, Float& /*sampling*/, 
     286             :                            Int& /*xSupport*/, Int& /*ySupport*/, const Double& /*freqValue*/, 
     287             :                            const Double& /*wValue*/, const Int& /*muellerElement*/,
     288             :                            const String& /*fileName*/)
     289             :   {
     290             :     /*
     291             :     RigidVector<Int,3> ndx=setParams(cs, sampling, xSupport, ySupport,
     292             :                                      freqValue, wValue, muellerElement);
     293             :     // Adding degenerate axis here to make life easier when using these
     294             :     // buffers to write them as Images later (with a 4D co-ordinate
     295             :     // system - the degenerate axis become the Freq. and Polarization
     296             :     // axis).
     297             : 
     298             :     //    cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->storage_p->resize(IPosition(4,nx,ny,1,1));
     299             :     cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->shape_p=IPosition(4,nx,ny,1,1);
     300             :     */
     301           0 :   }
     302             :   //
     303             :   //---------------------------------------------------------------
     304             :   //
     305             :   //  template<class T>  Array<T>& CFBuffer<T>::
     306           0 :   CFCell& CFBuffer::getCFCell(const Int& i, const Int& j, const Int& k)
     307             :   {
     308           0 :     return *cfCells_p(i,j,k); // Nfreq x Nw x Nmueller
     309             :   }
     310             :   //
     311             :   //---------------------------------------------------------------
     312             :   //
     313             :   //  template <class T>  Array<T>& CFBuffer<T>
     314           0 :   CFCell& CFBuffer::getCFCell(const Double& freqVal, 
     315             :                              const Double& wValue, 
     316             :                              const Int& muellerElement) // muellerElement: (i,j) of the Mueller Matrix
     317             :   {
     318           0 :     RigidVector<Int,3> ndx=getIndex(freqVal, wValue, muellerElement);
     319           0 :     return getCFCell(ndx(0), ndx(1),ndx(2));
     320             :   }
     321             :   //
     322             :   //---------------------------------------------------------------
     323             :   //
     324             :   //  template<class T>  Array<T>& CFBuffer<T>::
     325           0 :   CountedPtr<CFCell>& CFBuffer::getCFCellPtr(const Int& i/*FreqNdx*/, const Int& j/*WNdx*/, const Int& k/*MuellerNdx*/)
     326             :   {
     327             :     // IPosition shp=cfCells_p.shape();
     328             :     // if (cfHitsStats.shape().product()==0)
     329             :     //   {
     330             :     //  cfHitsStats.resize(shp);
     331             :     //  cfHitsStats = 0;
     332             :     //   }
     333             :     // try
     334             :     //   {
     335             :     //  AlwaysAssert(((i<shp[0]) && (j<shp[1]) && (k<shp[2])) , AipsError);
     336             :     //   }
     337             :     // catch (AipsError x)
     338             :     //   {
     339             :     //  cerr << "#### " << i << " " << j << " " << k << " " << shp << endl;
     340             :     //  throw(x);
     341             :     //   }
     342             : 
     343             :     // cfHitsStats(i,j,k)++;
     344             :     // //    cerr << "CFBuffer: Cell: " << i << " " << j << " " << k << " " << cfCells_p(i,j,k)->xSupport_p << endl;
     345           0 :     return cfCells_p(i,j,k); // Nfreq x Nw x Nmueller
     346             :   }
     347             :   //
     348             :   //---------------------------------------------------------------
     349             :   //
     350             :   //  template <class T>  Array<T>& CFBuffer<T>
     351           0 :   CountedPtr<CFCell>& CFBuffer::getCFCellPtr(const Double& freqVal, 
     352             :                                              const Double& wValue, 
     353             :                                              const Int & muellerElement)
     354             :   {
     355           0 :     RigidVector<Int,3> ndx=getIndex(freqVal, wValue, muellerElement);
     356           0 :     return cfCells_p(ndx(0), ndx(1),ndx(2));
     357             :   }
     358             :   //
     359             :   //---------------------------------------------------------------
     360             :   //
     361             :   //  template<class T>  Vector<Int>& CFBuffer<T>
     362             :   // This should be made more efficient with binary search.
     363           0 :   RigidVector<Int,3> CFBuffer::getIndex(const Double& freqValue, 
     364             :                                         const Double& wValue, 
     365             :                                         const Int& muellerElement)
     366             :   {
     367           0 :     RigidVector<Int,3> ndx(-1);
     368           0 :     Int nF=cfCells_p.shape()(0), nW=cfCells_p.shape()(1), nM=cfCells_p.shape()(2);
     369             :     Int i,j,k;
     370             :     //UNUSED: Int di;
     371             : 
     372             :     // Double dfMin=0;di=0;
     373             :     // for (i=0;i<nF;i++)
     374             :     //   {
     375             :     //  Double df=fabs(cfCells_p(i,0,0)->freqValue_p - freqValue);
     376             :     //  if (df < dfMin) {dfMin=df; di=i;}
     377             :     //   }
     378             :     // i=di;
     379           0 :     for (i=0; i<nF; i++)
     380             :       //      if ((fabs(cfCells_p(i,0,0)->freqValue_p - freqValue) < cfCells_p(i,0,0)->freqIncr_p))
     381           0 :       if (cfCells_p(i,0,0)->freqValue_p == freqValue) break;
     382           0 :     for(j=0; j<nW; j++)   if (cfCells_p(i,j,0)->wValue_p == wValue) break;
     383           0 :     for (k=0; k<nM; k++)  if (cfCells_p(i,j,k)->muellerElement_p == muellerElement) break;
     384             : 
     385           0 :     ndx(0)=i;ndx(1)=j;ndx(2)=k;
     386             :     // for (Int i=0;i<nF;i++)
     387             :     //   for(Int j=0;j<nW;j++)
     388             :     //  for(Int k=0;k<nM;k++)
     389             :     //    {
     390             :     //      if (
     391             :     //          (fabs(cfCells_p(i,j,k)->freqValue_p - freqValue) < cfCells_p(i,j,k)->freqIncr_p) &&
     392             :     //          (cfCells_p(i,j,k)->wValue_p         == wValue) &&
     393             :     //          (cfCells_p(i,j,k)->muellerElement_p == muellerElement)
     394             :     //          )
     395             :     //        {ndx(0)=i;ndx(1)=j;ndx(2)=k;break;}
     396             :     //    }
     397             : 
     398             :     // cerr << "@#$%#@ " << freqValue 
     399             :     //   << " " << cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->freqValue_p
     400             :     //   << " " << cfCells_p(ndx(0),ndx(1),ndx(2))->freqIncr_p 
     401             :     //   << " " << ndx
     402             :     //   << endl;
     403             :     // for(uInt i=0;i<nF;i++)
     404             :     //   if (freqValue==cfCells_pfreqValues_p(i)) {ndx(0)=i;break;}
     405             : 
     406             :     // for(uInt i=0;i<wValues_p.nelements();i++)
     407             :     //   if (wValue==wValues_p(i)) {ndx(1)=i;break;}
     408             : 
     409             :     // ndx(2)=muellerElements_p(muellerElement(0),muellerElement(1));
     410             : 
     411           0 :     return ndx;
     412             :   }
     413             :   //
     414             :   //---------------------------------------------------------------
     415             :   //
     416           0 :   void CFBuffer::getParams(CoordinateSystem& cs, Float& sampling, 
     417             :                            Int& xSupport, Int& ySupport, 
     418             :                            String& bandName,
     419             :                            const Double& freqVal, const Double& wValue, 
     420             :                            const Int& muellerElement)
     421             :   {
     422           0 :     RigidVector<Int,3> ndx=getIndex(freqVal, wValue, muellerElement);
     423           0 :     getParams(cs, sampling, xSupport, ySupport, bandName, ndx(0), ndx(1), ndx(2));
     424           0 :   }
     425             :   //
     426             :   //---------------------------------------------------------------
     427             :   //
     428           0 :   Double CFBuffer::nearest(Bool& found, const Double& val,
     429             :                            const Vector<Double>& valList,
     430             :                            const Double& /*incr*/)
     431             :   {
     432           0 :     Int n=valList.nelements();
     433           0 :     if (n==1) {found=true;return valList[0];}
     434           0 :     Int where = binarySearch(found, valList, val, n);
     435           0 :     if (found) return valList(where);
     436           0 :     else return -1.0;
     437             :   }
     438             :   //
     439             :   //---------------------------------------------------------------
     440             :   //
     441           0 :   Int CFBuffer::nearestNdx(const Double& val,
     442             :                            const Vector<Double>& /*valList*/,
     443             :                            const Double& incr)
     444             :   {
     445           0 :     return SynthesisUtils::nint(incr*val);
     446             : 
     447             :     // Int n=valList.nelements();
     448             :     // if (n==1) return 0;
     449             :     // else return -1;
     450             : 
     451             :     // Int where = binarySearch(found, valList, val, n);
     452             :     // if (found) return valList(where);
     453             :     // else return -1.0;
     454             :   }
     455             :   //
     456             :   //---------------------------------------------------------------
     457             :   //
     458             :   //  template <class T>  void CFBuffer<T>
     459           0 :   void CFBuffer::show(const char *Mesg,ostream &os)
     460             :   {
     461           0 :     LogIO log_l(LogOrigin("CFBuffer","show[R&D]"));
     462             : 
     463           0 :     if (Mesg != NULL) os << Mesg << endl;
     464           0 :     os << "---------------------------------------------------------" << endl
     465           0 :        << "Shapes: " << cfCells_p.shape() << endl;
     466           0 :     for (Int i=0;i<cfCells_p.shape()(0);i++)
     467           0 :       for (Int j=0;j<cfCells_p.shape()(1);j++)
     468           0 :         for (Int k=0;k<cfCells_p.shape()(2);k++)
     469             :           {
     470           0 :             os << "CFCell["<<i<<","<<j<<","<<k<<"]:" << endl;
     471           0 :             cfCells_p(i,j,k)->show(Mesg, os);
     472           0 :             os << "Pointing offset: " << pointingOffset_p << endl;
     473             :           }
     474           0 :     os << "---------------------------------------------------------" << endl;
     475           0 :   }
     476             : 
     477           0 :   void CFBuffer::makePersistent(const char *dir, const char *cfName)
     478             :   {
     479           0 :     for (Int i=0;i<cfCells_p.shape()(0);i++)
     480           0 :       for (Int j=0;j<cfCells_p.shape()(1);j++)
     481           0 :         for (Int k=0;k<cfCells_p.shape()(2);k++)
     482             :           {
     483           0 :             ostringstream name;
     484           0 :             name << String(cfName) << "_CF_" << i << "_" << j << "_" << k << ".im";
     485             :             //cerr << "CFB Name : " << name.str() << endl;
     486             :             // const char *formedName;
     487             :             // if (cfName != "" ) formedName = name.str().c_str();
     488             :             // else               formedName = cfName;
     489             :             // cerr << "Formed name = " << formedName << endl;
     490           0 :             cfCells_p(i,j,k)->makePersistent(dir, name.str().c_str());
     491           0 :           }
     492           0 :   }
     493             : 
     494           0 :   Int CFBuffer::nearestFreqNdx(const Double& freqVal) 
     495             :   {
     496             :     Int index;
     497           0 :     SynthesisUtils::nearestValue(freqValues_p, freqVal, index);
     498           0 :     return index;
     499             :     // // The algorithm below has a N*log(N) cost.
     500             :     // Vector<Double> diff = fabs(freqValues_p - freqVal);
     501             :     // Bool dummy;
     502             :     // Sort sorter(diff.getStorage(dummy), sizeof(Double));
     503             :     // sorter.sortKey((uInt)0,TpDouble);
     504             :     // Int nch=freqValues_p.nelements();
     505             :     // Vector<uInt> sortIndx;
     506             :     // sorter.sort(sortIndx, nch);
     507             :     
     508             :     // return sortIndx(0);
     509             : 
     510             :     // Int ndx=min(freqValues_p.nelements()-1,max(0,SynthesisUtils::nint((freqVal-freqValues_p[0])/freqValIncr_p)));
     511             :     // return ndx;
     512             :   }
     513             : 
     514             : 
     515           0 :   void CFBuffer::primeTheCache()
     516             :   {
     517             :     //
     518             :     // In each CFCell of this CFBuffer, cache things that might be
     519             :     // required in tight loops and can be expensive to extract
     520             :     // otherwise.
     521             :     //
     522           0 :     IPosition cfCShape=cfCells_p.shape();
     523           0 :     for (Int i=0; i < cfCShape(0); i++)
     524           0 :       for (Int j=0; j < cfCShape(1); j++)
     525           0 :         for (Int k=0; k < cfCShape(2); k++)
     526           0 :           getCFCellPtr(i,j,k)->initCache();
     527           0 :   }
     528             : 
     529           0 :   void CFBuffer::initMaps(const VisBuffer2&, // vb, 
     530             :                           const Matrix<Double>& freqSelection, const Double& imRefFreq)
     531             :   {
     532           0 :     Vector<Double> spwList=freqSelection.column(0);
     533           0 :     Int maxSpw=(Int)(max(spwList));
     534           0 :     freqNdxMap_p.resize(maxSpw+1);
     535           0 :     conjFreqNdxMap_p.resize(maxSpw+1);
     536             : 
     537           0 :     for (Int i=0;i<(Int)spwList.nelements(); i++)
     538             :       {
     539           0 :         Int spw=(Int)freqSelection(i,0);
     540           0 :         Double fmin=freqSelection(i,1), fmax=freqSelection(i,2), finc=freqSelection(i,3);
     541           0 :         Int nchan = (Int)((fmax-fmin)/finc + 1);
     542           0 :         freqNdxMap_p[spw].resize(nchan,True);
     543           0 :         conjFreqNdxMap_p[spw].resize(nchan,True);
     544           0 :         for (Int c=0;c<nchan;c++)
     545             :           {
     546           0 :             Double freq=fmin+c*finc;
     547           0 :             Double conjFreq=sqrt(2*imRefFreq*imRefFreq - freq*freq);
     548           0 :             freqNdxMap_p[spw][c]=nearestFreqNdx(freq);
     549           0 :             conjFreqNdxMap_p[spw][c]=nearestFreqNdx(conjFreq);
     550             :           }
     551             :       }
     552             : 
     553             :     
     554             :     // cerr << "CFBuffer::initMaps: " 
     555             :     //   << freqSelection << endl
     556             :     //   << freqValues_p << endl
     557             :     //   << freqNdxMap_p << endl
     558             :     //   << conjFreqNdxMap_p << endl;
     559             : 
     560           0 :   }
     561             : 
     562           0 :   void CFBuffer::initPolMaps(PolMapType& polMap, PolMapType& conjPolMap) 
     563             :   {
     564           0 :     muellerElementsIndex_p.assign(polMap);
     565           0 :     conjMuellerElementsIndex_p.assign(conjPolMap);
     566           0 :   }
     567             : 
     568           0 :   void CFBuffer::getFreqNdxMaps(Vector<Vector<Int> >& freqNdx, Vector<Vector<Int> >& conjFreqNdx)
     569             :   {
     570             :     Int nspw;
     571           0 :     nspw=freqNdxMap_p.nelements();
     572           0 :     freqNdx.resize(nspw);
     573           0 :     for (Int s=0;s<nspw;s++)
     574           0 :       freqNdx[s].assign(freqNdxMap_p[s]);
     575             : 
     576           0 :     nspw=conjFreqNdxMap_p.nelements();
     577           0 :     conjFreqNdx.resize(nspw);
     578           0 :     for (Int s=0;s<nspw;s++)
     579           0 :       conjFreqNdx[s].assign(conjFreqNdxMap_p[s]);
     580           0 :   }
     581             : 
     582           0 :   void CFBuffer::ASSIGNVVofI(Int** &target,Vector<Vector<Int> >& source, Bool& doAlloc)
     583             :   {
     584             :     // cerr << "Source: " << target << " " << source << endl;
     585             : 
     586             :     Int nx,ny;                                  
     587           0 :     Bool b=(doAlloc||(target==NULL));
     588           0 :     nx=source.nelements();
     589           0 :     if (b) target=(int **)malloc(nx*sizeof(int*));
     590           0 :     for (int i=0;i<nx;i++)
     591             :       {
     592           0 :         ny = source[i].nelements();
     593           0 :         if (b) (target[i]) = (int *)malloc(ny*sizeof(int));
     594           0 :         for (int j=0;j<ny;j++)
     595           0 :           (target)[i][j]=source[i][j];
     596             :       }
     597             : 
     598             :     // cerr << "Target: ";
     599             :     // for (int ii=0;ii<source.nelements();ii++)
     600             :     //   {
     601             :     //  Int ny=source[ii].nelements();
     602             :     //  for(Int jj=0;jj<ny;jj++)
     603             :     //    cerr << target[ii][jj] << " ";
     604             :     //  cerr << endl;
     605             :     //   }
     606           0 :   }
     607             : 
     608           0 :   void CFBuffer::getAsStruct(CFBStruct& st)
     609             :   {
     610           0 :     Vector<Int> shp=cfCells_p.shape().asVector();
     611             : 
     612           0 :     Bool doAlloc=(st.CFBStorage == NULL);
     613             : 
     614           0 :     st.shape[0]=shp[0];
     615           0 :     st.shape[1]=shp[1];
     616           0 :     st.shape[2]=shp[2];
     617           0 :     st.fIncr = freqValIncr_p; st.wIncr = wValIncr_p;
     618             : 
     619             : 
     620             :     Bool dummy;
     621           0 :     Int n=cfCells_p.nelements();
     622           0 :     if (doAlloc) st.CFBStorage = (CFCStruct *)malloc(n*sizeof(CFCStruct));
     623           0 :     CountedPtr<CFCell> *cfstore=cfCells_p.getStorage(dummy);
     624           0 :     for (int i=0;i<n;i++)
     625             :       {
     626             :         //        st.CFBStorage[i]=(CFCStruct *)malloc(sizeof(CFCStruct));
     627           0 :         (cfstore[i]).operator->()->getAsStruct(st.CFBStorage[i]);
     628             :       }
     629             :     //  st.CFBStorage[i] = (cfstore[i]).operator->()->getStorage()->getStorage(dummy);
     630             :     
     631             :     // if (doAlloc) st.pointingOffset=(Double *)malloc(pointingOffset_p.nelements()*sizeof(Double));
     632             :     // for (uInt i=0;i<pointingOffset_p.nelements();i++) st.pointingOffset[i]=pointingOffset_p[i];
     633             : 
     634           0 :     if (doAlloc) st.freqValues=(Double *)malloc(freqValues_p.nelements()*sizeof(Double));
     635           0 :     for (uInt i=0;i<freqValues_p.nelements();i++) st.freqValues[i]=freqValues_p[i];
     636             : 
     637           0 :     if (doAlloc) st.wValues=(Double *)malloc(wValues_p.nelements()*sizeof(Double));
     638           0 :     for (uInt i=0;i<wValues_p.nelements();i++) st.wValues[i]=wValues_p[i];
     639             : 
     640           0 :     ASSIGNVVofI(st.muellerElements, muellerElements_p, doAlloc);
     641           0 :     ASSIGNVVofI(st.muellerElementsIndex, muellerElementsIndex_p,doAlloc);
     642           0 :     ASSIGNVVofI(st.conjMuellerElements, conjMuellerElements_p,doAlloc);
     643           0 :     ASSIGNVVofI(st.conjMuellerElementsIndex, conjMuellerElementsIndex_p,doAlloc);
     644             : 
     645           0 :     st.nMueller = muellerElements_p.nelements();
     646             :     
     647           0 :     Vector<Vector<Int> > freqNdx, conjFreqNdx;
     648           0 :     getFreqNdxMaps(freqNdx, conjFreqNdx);
     649           0 :     ASSIGNVVofI(st.freqNdxMap, freqNdx, doAlloc);
     650           0 :     ASSIGNVVofI(st.conjFreqNdxMap, conjFreqNdx, doAlloc);
     651           0 :   }
     652             :   
     653             :   //
     654             :   //----------------------------------------------------------------------
     655             :   //
     656           0 :   void CFBuffer::fill(const Int& /*nx*/, const Int& /*ny*/, 
     657             :                       const Vector<Double>& freqValues,
     658             :                       const Vector<Double>& wValues,
     659             :                       const PolMapType& muellerElements)
     660             :   {
     661             : 
     662           0 :     LogIO log_l(LogOrigin("CFBuffer", "fillBuffer[R&D]"));
     663           0 :     for (uInt imx=0;imx<muellerElements.nelements();imx++) // Loop over all MuellerElements
     664           0 :       for (uInt imy=0;imy<muellerElements(imx).nelements();imy++)
     665             :         {
     666           0 :             for (uInt inu=0;inu<freqValues.nelements();inu++) // All freq. channels
     667             :               {
     668           0 :                 for (uInt iw=0;iw<wValues.nelements();iw++)     // All w-planes
     669             :                   {
     670             :                     log_l << " CF("
     671           0 :                           << "M:"<<muellerElements(imx)(imy) 
     672             :                           << ",C:" << inu 
     673           0 :                           << ",W:" << iw << "): ";
     674           0 :                     Vector<Double> ftRef(2);
     675             : 
     676             :                     // ftRef(0)=cfWtBuf.shape()(0)/2.0;
     677             :                     // ftRef(1)=cfWtBuf.shape()(1)/2.0;
     678           0 :                     CoordinateSystem ftCoords;//=cs_l;
     679             :                     // SynthesisUtils::makeFTCoordSys(cs_l, cfWtBuf.shape()(0), ftRef, ftCoords);
     680             : 
     681             :                     // cfb.setParams(inu,iw,imx,imy,//muellerElements(imx)(imy),
     682             :                     //            ftCoords, sampling, xSupport, ySupport,
     683             :                     //            freqValues(inu), wValues(iw), muellerElements(imx)(imy));
     684             :                     // cfb.getCFCellPtr(freqValues(inu), wValues(iw), 
     685             :                     //               muellerElements(imx)(imy))->pa_p=Quantity(vbPA,"rad");
     686             :                     //
     687             :                     // Now tha the CFs have been computed, cache its
     688             :                     // paramters in CFCell for quick access in tight
     689             :                     // loops (in the re-sampler, e.g.).
     690             :                     //
     691           0 :                     (getCFCellPtr(freqValues(inu), wValues(iw), 
     692           0 :                                   muellerElements(imx)(imy)))->initCache();
     693           0 :                   }
     694             :               }
     695             :         }
     696           0 :   }
     697             :   //
     698             :   //----------------------------------------------------------------------
     699             :   //
     700           0 :   int CFBuffer::getMaxCFSize()
     701             :   {
     702           0 :     if (maxCFSize_p < 0)
     703             :       {
     704           0 :         IPosition shp(cfCells_p.shape());
     705           0 :         for (Int i=0;i < shp[0]; i++)
     706           0 :           for (Int j=0; j < shp[1]; j++)
     707           0 :             for (Int k=0; k < shp[2]; k++)
     708             :               {
     709           0 :                 int cfNX = SynthesisUtils::getCFShape(getCFCacheDir(), cfCells_p(i,j,k)->fileName_p)[0];
     710           0 :                 if (cfNX > maxCFSize_p) maxCFSize_p=cfNX;
     711             :               }
     712           0 :       }
     713           0 :     return maxCFSize_p;
     714             :   }
     715             :   //
     716             :   //----------------------------------------------------------------------
     717             :   //
     718           0 :   bool CFBuffer::finitePointingOffsets()
     719             :   {
     720           0 :     return ((fabs(pointingOffset_p(0)(0))>0) ||  
     721           0 :             (fabs(pointingOffset_p(0)(1))>0));
     722             : 
     723             :   }
     724             :   
     725             : } // end casa namespace
     726             : 
     727             : 
     728             : 

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